Trauksmes celšanas dēļ nav pieļaujams radīt nelabvēlīgas sekas ne trauksmes cēlējam, ne viņa radiniekiem vai saistītajām personām.     
Nelabvēlīgu seku radīšana ir tieša vai netieša darbība vai bezdarbība, kas izraisa vai var izraisīt nelabvēlīgas sekas, tostarp draudi vai mēģinājums šādas sekas radīt.  
Nelabvēlīgas sekas arī sauc par represijām. Represijas var radīt nepamatotu kaitējumu trauksmes cēlējam.
Nelabvēlīgas sekas trauksmes celšanas dēļ var būt, piemēram,      
•    disciplināra vai citāda sodīšana,      
•    atbrīvošana no darba vai amata, darba līguma nepagarināšana,
•    pazemināšana amatā, pārcelšana citā darbā vai amatā,      
•    amata pienākumu mainīšana,
•    negatīvs darba vērtējums,
•    atkāpšanas no preces piegādes vai pakalpojuma izmantošanas,
•    goda, cieņas, reputācijas aizskaršana,
•    nevienlīdzīga attieksme,
•    iesniegt nepatiesu pieteikumu tiesā,
•    citādi tieši vai netieši radītas nelabvēlīgas sekas.
Pienākums pierādīt, ka nelabvēlīgās sekas trauksmes cēlējam, viņa radiniekam vai saistītajai personai nav saistītas ar trauksmes cēlēja ziņojumu, ir pusei, kas šīs sekas radījusi.

Kā rīkoties, ja radušās nelabvēlīgas sekas trauksmes celšanas dēļ? 
Šādā gadījumā var būt dažādi rīcības scenāriji. 
Trauksmes cēlējs darba tiesiskajās vai citās civiltiesiskās attiecībās var  vērsties ar prasības pieteikumu vispārīgās jurisdikcijas tiesā.
Trauksmes cēlējs valsts dienestā - atkarībā no gadījuma - var vērsties vispārīgās jurisdikcijas tiesā vai rīkoties Administratīvā procesa likumā noteiktajā kārtībā.
Valsts dienestā var hierarhiskā kārtībā apstrīdēt vai pārsūdzēt veikto faktisko rīcību vai pieņemto lēmumu, novērst savu tiesību aizskārumu.
Trauksmes cēlējs, viņa radinieks un saistītā persona, ja tas nepieciešams aizsardzībai pret trauksmes celšanas dēļ radītajām nelabvēlīgajām sekām, ir atbrīvots no pienākuma ievērot lietas ārpustiesas izskatīšanas kārtību administratīvajā procesā, proti, pirms vēršanās tiesā par iestādes pieņemto lēmumu vai rīcību var neapstrīdēt augstākā iestādē, bet uzreiz pārsūdzēt Administratīvās rajona tiesas tiesu namā. Ja ir saprātīgi uzskatīt, ka iestāde nav ieinteresēta objektīvā lietas izskatīšanā, var uzreiz vērsties tiesā.
Tāpat, piemēram, par nepatiesa pieteikuma iesniegšanu tiesā personai var uzlikt naudas sodu Civilprocesa likumā noteiktajā kārtībā, tas ir, Civilprocesa likuma 73.1 panta trešajā daļā ir noteikts, ka par apzināti nepatiesa pieteikuma, prasības pieteikuma vai sūdzības, izņemot blakus sūdzības, apelācijas vai kasācijas sūdzības, iesniegšanu nolūkā sasniegt prettiesisku mērķi vai kavēt tiesību vai likumisko interešu aizsardzību tiesa var uzlikt pusei naudas sodu līdz 1200 euro.
Visbeidzot, pret personu, kura sekas radījusi, var tikt piemērota administratīvā atbildība par nelabvēlīgu seku radīšanu trauksmes cēlējam, viņa radiniekam vai saistītajai personai. To var piemērot Valsts darba inspekcija (par pārkāpumiem darba tiesisko attiecību un valsts civildienesta jomā) vai Valsts policija (citās jomās).